На 25 декември 2001 г. в португалската столица Лисабон се създава Българската православна църковна община "Св. Иоан Рилски - Чудотворец". Формалният повод за това е преместването и преустройството на параклис от дома на Царица Иоанна (съпруга на цар Борис ІІІ и майка на последния български цар Симеон ІІ) в двора на българското посолство в Лисабон, след нейната смърт (29.02.2000 г.).
Параклисът е осветен на 3 март 2001 г. от негово високопреосвещенство блаженно почившия Западно- и средноевропейски митрополит Симеон.
Активната църковна дейност в параклиса започва през 2003 г., когато за енорийски свещеник е назначен отец Гоце Христов. В богослуженията участват както българи, така и представители на други националности – руснаци, украинци, молдовци.
През ноември 2007 г. църковната община на българите получава официална регистрация по закона за религиозните лица в Португалия. През 2011 г., навръх Рождество Христово църковната община получава и самостоятелен храм за безвъзмездно ползване, предоставен от католическата църква. Храмът се намира в лисабонския квартал Линда-а-Веля (Linda-a-Velha).
До септември 2025 година БПЦО е ползвала храма „Capela de Nossa Senhora do Cabo“. Във връзка с настъпили промени в българската църковна община „Св. Иван Рилски“ в гр. Лисабон, храмът „Capela de Nossa Senhora do Cabo“ е върнат на Католическата църква. В отговор на отправена молба от Западно- и Средноевропейски митрополит Антоний Посолството е оказало съдействие за временно съхранение на църковната утвар, собственост на Българската православна църква на територията на Посолството на Република България в Лисабон. На 1 март 2026 г. църковната утвар е транспортирана от Лисабон до Страсбург.
На територията на посолството на Република България в Лисабон се намира българският православен параклис „Св. Йоан Рилски”. При необходимост и при присъствие на духовно лице в него могат да бъдат извършвани богослужения и други църковни дейности.
Свещеник: отец Захарий Бозов(2025)
Адресът на параклиса в Лисабон е: R. Sacramento à Lapa 31.
